Лаборатория диагностики ВИЧ и сопутствующих инфекций

 
Заведующий лабораторией:
Владимир Федорович ЕРЁМИН
доктор медицинских наук, профессор
Тел.: +375-172 68 04 16
E-mail: Этот адрес электронной почты защищен от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
 
 

История создания

Лаборатория диагностики ВИЧ и сопутствующих инфекций как самостоятельная структура в НИИ эпидемиологии и микробиологии была организована 01.09.1998 и сохранила название до настоящего времени.

Создание лаборатории было обусловлено тем, что проблема ВИЧ-инфекции, а также парентеральных гепатитов В и С становились все более и более актуальными и требовали внедрения новых более технологичных и эффективных методов контроля за возбудителями, разработки новых диагностических тестов.

В соответствии с приказом Министерства здравоохранения Республики Беларусь от 14.05.2012 № 546 "О возложении функций Республиканской референс-лаборатории генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С по определению генотипов/субтипов и резистентности к противовирусным препаратам ВИЧ, гепатитов В и С" на базе лаборатории функционирует «Республиканская референс-лаборатория генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С по определению генотипов/подтипов и резистентности к противовирусным препаратам ВИЧ, гепатитов В и С».

Состав лаборатории в 2014 г.: заведующий, главный научный сотрудник, ведущий научный сотрудник, научный сотрудник, 3 младших научных сотрудника и 2 лаборанта.

В настоящее время в лаборатории работают 2 доктора медицинских наук, 2 кандидата биологических наук.

 

 Сотрудники лаборатории диагностики ВИЧ и сопутствующих инфекций

1 ряд (слева направо): Матлах О.Л., Силантьева О.В., Немира А.С., д.м.н. Кучеров И.И., Царь А.И.

2 ряд (слева направо): Домнич М.В, Шишкин Е.А., д.м.н. Еремин В.Ф., к.б. н. Сосинович С.В. 

 

ГАСИЧ Елена Леонидовна 

канд. биол. наук,ведущий научный сотрудник  

СОСИНОВИЧ Святослав Викторович

 канд. биол. наук, научный сотрудник 

ТУЛИНОВА М.

младший научный сотрудник 

ЦАРЬ А.И.

лаборант

МАТЛАХ О.Л.

младший научный сотрудник

НЕМИРА А.С.

младший научный сотрудник

СИЛАНТЬЕВА О.В.

лаборатнт 

 

 

Современные направления деятельности

В настоящее время лаборатория оснащена современным оборудованием, что позволяет проводить научные и прикладные исследования на самом высоком уровне по следующим направлениям: 

  • молекулярно-эпидемиологический мониторинг (определение генотипов/подтипов) циркуляции ВИЧ-1, вирусов гепатитов В, С и вируса папилломы человека (ВПЧ) высокого онкогенного риска в разных группах населения;
  • определение мутаций резистентности к препаратам антивирусной терапии ВИЧ-1, гепатитов В, С;
  • поиск новых антивирусных соединений-ингибиторов ВИЧ-1;
  • проведение экспертных исследований по расшифровке случаев умышленного инфицирования или заражения через кровь и ее продукты (ВИЧ, вирусами гепатитов В и С), расшифровка очаговых случаев инфицирования вирусами гепатитов В и С;
  • экспертное исследование новых дезинфектантов для последующего их использования в отношении инактивации ВИЧ, гепатитов В и С;
  • лабораторная диагностика ВИЧ, гепатитов В и С, ИППП, вирусов герпетической группы и других возбудителей с использованием современных молекулярно-биологических методов;
  • помощь лабораториям центра и другим учреждениям республики в определении генотипов/подтипов, мутаций резистентности вирусных и бактериальных патогенов, возбудителей болезней человека и животных.

Основные научно-практические достижения

1. Впервые среди стран СНГ определены виды, генотипы и подтипы вируса папилломы человека (ВПЧ) высокого онкогенного риска, разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за ВПЧ высокого онкогенного риска.  Отработаны условия проведения ПЦР, секвенирующей ПЦР и секвенирование с парами праймеров к L1, Е6/Е7 участкам ВПЧ-16, 18, 45. Проведенное секвенирование и последующий филогенетический анализ по данным участкам более 100 образцов позволили установить, что на территории Республики Беларусь циркулируют в основном варианты ВПЧ-16, 18, 45, занесенные недавно из стран юго-восточной Азии. Вместе с тем, нами было показано, что на территории страны циркулируют «старые» местные варианты ВПЧ высокого онкогенного риска, а также вирусы с Африканского континента, и это необходимо учитывать при выборе вакцин и оценке эффективности поствакцинального иммунитета. Впервые описан новый вариант ВПЧ-16 типа. Подготовлен проект инструкции «Молекулярно-генетический мониторинг за вирусом папилломы человека высокого онкогенного риска».

2. ВИЧ-инфекция: впервые мире описана новая уникальная рекомбинантная форма ВИЧ-1, на которую в 2013 г. получен патент Республики Беларусь № 18124, разработана и успешно используется в лаборатории тест-система для генотипирования ВИЧ-1 по участкам генов gag-env ВИЧ-1 (рег. удостоверение № ИМ-7.95957), позволяющая определять подтипы вируса, циркулирующие на территории Беларуси, расшифровывать случаи умышленного инфицирования, вспышки ВИЧ-инфекции и случаи инфицирования через кровь и ее продукты. Разработана и применяется система молекулярно-эпидемиологического мониторинга циркуляции подтипов ВИЧ-1 на территории страны. Показано, что на территории Республики Беларусь продолжает доминировать подтип А1 ВИЧ-1, на который приходится более 85% всех новых случаев инфицирования. В тоже время, в стране увеличивается количество выявленных рекомбинантных форм, на которые уже приходится более 6% новых случаев инфицирования, при этом, если ранее рекомбинантные формы на территорию страны «завозились» из-за пределов, то в последнее время наблюдается формирование новых рекомбинантных форм на территории страны. Впервые в Гомельской области у двоих пациентов выявлен подтип G ВИЧ-1 и показано, что оба пациента получили вирус из одного источника, а в Минской области у двоих пациентов выявлен новый вариант рекомбинантной формы CRF02_AG. Разработана технология получения контрольной панели антигена/сывороток крови, содержащей и не содержащей антитела к ВИЧ-1 и антиген вируса (рег. удостоверение № ИМ-7.95269/0912). Разработана контрольная панель сывороток и антигена ВИЧ-1. Подготовлена инструкция «Молекулярно-эпидемиологический мониторинг за циркуляцией разных субтипов ВИЧ-1». Разработана и успешно прошла предрегистрационные испытания тест-система «Миниблот ВИЧ-1А/В».

У 86 пациентов (из них 20 дети), находящихся на ВААРТ, выявлены мутации резистентности высокого уровня. Всего на резистентность было проверено около 500 образцов сыворотки/плазмы крови. Определение мутаций резистентности осуществляли как с использованием коммерческой тест-системы, так и с применением разрабатываемой нами тест-системы для генотипирования ВИЧ-1. Своевременное определение резистентных штаммов ВИЧ-1 позволяет эффективнее использовать разные схемы терапии и значительно улучшать жизненный статус пациентов. Отработаны условия проведения ПЦР в «гнездовом» варианте, позволяющие получать фрагмент генов gag-pol ВИЧ-1 размером 1600п.о. Показано, что разработанная нами тест-система ПЦР не уступает коммерческому набору по чувствительности и специфичности, но при этом, в два раза дешевле (15000 и 7500 долларов США). В Международную базу данных GenBank передано более 300 последовательностей ВИЧ-1.

Совместно с российскими коллегами получено 4 патента Российской Федерации на новые антивирусные соединения.

3. Гепатиты В и С.
Гепатит В. Разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга циркуляции ВГВ. Проведенные исследования показали, что на территории страны доминирует D генотип вируса гепатита В, на который приходится 82,6% всех проанализированных случаев. Генотип А был выявлен в 15,7%, генотип С в 5 (1,4%) образцах. Впервые в одной пробе, полученной от пациента из Вьетнама был обнаружен В4 подтип вируса гепатита В. Как показал филогенетический анализ полученных нуклеотидных последовательностей ДНК, все изученные изоляты генотипа А относились к подтипу А2, а генотипа С – к подтипу С2 ВГВ. При этом все образцы с генотипом А ВГВ были получены от жителей Беларуси, а генотип С определялся у граждан Вьетнама и Китая, прибывших на работу в нашу страну. Среди образцов, отнесенных к генотипу D вируса, 44,5% образцов относились к D2 подтипу, 30,3% – к D3 подтипу, 23,8% – к D1 подтипу, и 1,4% – к D4 подтипу вируса. При этом необходимо отметить, что D4 подтип вируса был занесен в Беларусь из Австралии. У 11 детей в возрасте от 6 месяцев до 12 лет в 4-х случаях определялся D3 подтип ВГВ, по 3 случая D1 и D2 подтип вируса и в одном случае нами был выявлен D4 подтип.

Гепатит С. Разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за циркуляцией ВГС. За период с июля 2012 г. по январь 2014 г. было исследовано 438 образцов сывороток/плазмы крови на определение генотипа вируса гепатита С, полученных от пациентов из разных регионов Республики Беларусь. Из 438 проб 106 были от пациентов с ВИЧ-инфекцией, заразившихся парентерально при совместном введении внутривенно наркотиков. 95 (89,6%) пациентов имели ко-инфекцию ВИЧ+ВГС и 11 (10,4%) ВИЧ+ВГС+ВГВ. Проведенные исследования по генотипированию ВГС в целом по Республике Беларусь показали, что более 80% всех случаев вызвано 1b (53,8%) и 3a (28,8%) генотипами вируса. У ВИЧ-инфицированных пациентов с ко-инфекцией ВГС и/или ВГВ, практически с одинаковой частотой, определялись 3a и 1b 38 (35,5±4,0%) и 37 (34,6±4,6%), соответственно, генотипы ВГС. 1a генотип был обнаружен в 25 пробах (23,4±4,0%), в 3 образцах (2,8%±2,4%) определялся 2а генотип и в 2 и 1 пробах 2k (1,9±1,3%) и 2с (0,9±0,9%) генотипы, соответственно. Зарегистрирована «Панель контрольная сывороток крови, содержащих антитела к специфическим белкам ВГС и сывороток крови разных генотипов ВГС» (рег. удостоверение № ИМ-7.98746).

В лаборатории успешно осуществляется работа по внебюджетной деятельности: диагностика ИППП, парентеральных гепатитов В и С, ВИЧ, ВПЧ, вирусов герпетической группы.

 

Подготовка кадров высшей квалификации

В лаборатории подготовлены:

- 1 доктор биологических наук по специальности «03.00.06 - вирусология» - 2002 г.
- 3 кандидата медицинских наук по специальностям «03.00.07 – микробиология» - 2007 г. и «14.00.10 – инфекционные болезни» - 2009 г., "14.02.02 - эпидемиология", "03.02.02 - вирусология" - 2016 г.

- 1 кандидат биологических наук по специальности "03.02.02 - вирусология" - 2016 г.
 
В настоящее время в лаборатории готовятся 2 доктора наук и 4 кандидата наук.

За время существования лаборатории 9 студентов БГУ проходили практику и готовили дипломные работы.

Международное сотрудничество

Лаборатория тесно сотрудничает с зарубежными коллегами. Сотрудники лаборатории работали и проходили стажировки в ведущих научных учреждениях США (Национальный институт здоровья), Японии (Национальный институт здоровья), Германии (Институт Роберта Коха и Институт физиологической химии), Голландии (Медицинский центр Амстердамского университета), Испании (Институт Карлоса IV), России (Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского в Москве; Институт особочистых биопрепаратов в Санкт-Петербурге, Институт технической химии в Перми, ФГУП НПО «Микроген» в Москве).

В настоящее время лаборатория сотрудничает со шведскими коллегами, и по достигнутой договоренности с сентября 2014 г. сотрудник лаборатории будет проходить стажировку в Каролинском Университете в Стокгольме.

Сотрудники лаборатории участвовали в выполнении международных грантов МНТЦ, ИНТАС и др.


Основные публикации

Eremin, V.F. A new unique recombinant HIV type 1 isolated from a child born to an HIV-infected mother / V.F. Eremin, E.L. Gasich, S.V. Sasinovich // AIDS Res. Hum. Retroviruses. – 2011. – Vol. 27, N 12. – P. 1323-1326. –  Available online:  http://www.liebertonline.com/doi/abs/10.1089/aid.2011.0112

Вергейчик, Г.И. Молекулярная эпидемиология генитальной папилломавирусной инфекции в Республике Беларусь / Г.И. Вергейчик, В.Ф. Еремин // Журн. микробиол. – 2012. – № 2. – С. 55-60.

HBV and HCV genotypes distribution on the territory of Belarus / E.L. Gasich, V.F. Eremin, S.V. Sasinovich, M.G. Tulinova // Abstr. 17th Int. Symp. HIV and Emerg. Infect. Dis. (ISHEID), Marseille, France. May 23-25, 2012. – Retrovirology. – 2012. Vol. 9 (suppl 1). – P. 57. – Available online: http://www.retrovirology.com/content/9/S1/P57

Генотипы вируса гепатита В, циркулирующие в Республике Беларусь / Е.Л. Гасич, В.Ф. Еремин, Н.Д. Коломиец, С.В. Сосинович, Е.Г. Фисенко, В.В. Пашкович, В.Л. Зуева, Т.А. Рогачева, М.Г. Тулинова // Здравоохранение. – 2012. – № 11. – С. 48-55.

Особенности развития эпидемии ВИЧ/СПИД в Гомельской области в 1999-2006 гг. Сообщение 2 / В.Ф. Еремин, Е.Л. Гасич, О.Н. Суетнов, Т.П. Грушко, П.Н. Грушко, С.В. Сосинович, В.В. Лукашов // Здравоохранение. – 2013. – № 3. – С. 21-29.

Особенности развития эпидемии ВИЧ/СПИДа в Гомельской области в 2008-2011 гг. Сообщение 3 / В.Ф. Еремин, Е.Л. Гасич, О.Н. Суетнов, Т.П. Грушко, П.Н. Грушко, С.В. Сосинович, В.С. Ильенкова, Е.Г. Фисенко, И.А. Карпов // Здравоохранение. – 2013. – № 4. – С. 14-26.

Рекомбинантная форма ВИЧ-1/Mos: BA (BgagApolAenv) для изучения генома и эволюции вируса ВИЧ-1 или скорости его изменчивости: пат. 18124 Респ. Беларусь, МПК C 12N 7/00 / В.Ф. Еремин, Е.Л. Гасич, С.В. Сосинович; заявитель. РНПЦ эпидемиол. и микробиол. – № а20110563; заявл. 29.04.11; опубл. 30.12.12. // Афіцыйны бюл. / Нац. цэнтр інтэлект. уласнасці. – 2014. – № 2. – С. 87-88.