В РНПЦ эпидемиологии и микробиологии разработан метод и проводятся исследования по определению чувствительности вируса гепатита С к новым противовирусным препаратам, подавляющим отдельные этапы репродукции вируса; появилась возможность полной элиминации вируса из организма. 

Появление препаратов дало надежду пациентам с гепатитом С на полное излечение. Однако вирус приспосабливается, что приводит к появлению в его геноме мутаций резистентности к применяемым препаратам. Несмотря на то, что врач подобрал правильную схему лечения и пациент соблюдает режимы приема препаратов, лечение может закончиться неудачей. Наиболее часто мутации появляются в участке, кодирующем NS5A белок ВГС, на который направлено действие таких препаратов как даклатосвир, омбитасвир, велпатасвир, ледипасвир, эльбасвир и др. Выявить такие мутации позволяют современные молекулярно-генетические методы. Более того, такие исследование включены в современные международные клинические рекомендации по диагностике и лечению хронического вирусного гепатита C и рекомендованы к назначению в следующих случаях:

- при первичном подборе терапии препаратами прямого противовирусного действия

- при отсутствии вирусологического ответа в течение 12-24 недель после начала лечения;

- при повторном выявлении РНК вируса в крови после достижения устойчивого вирусологического ответа;

- для прогноза эффективности лечения лекарственными препаратами прямого противовирусного действия.

В РНПЦ эпидемиологии и микробиологии выполняются исследования по определению мутаций лекарственной устойчивости для 1а и 1b подгенотипов, 2 генотипа, 3а и 4d подгенотипов вируса гепатита С. Результаты теста на лекарственную устойчивость позволяют подобрать наиболее эффективные схемы лечения и повышают шансы пациента на полное излечение от хронического гепатита С.