Лаборатория диагностики ВИЧ и сопутствующих инфекций более 20 лет занимается диагностикой вирусных и бактериальных инфекций. Основным методом исследования в лаборатории является полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высоко чувствительный и высоко специфический тест, позволяющий выявлять небольшое количество копий нуклеиновых кислот (ДНК/РНК) при острых и хронических формах инфекций. Лаборатория единственная в Беларуси проводит исследования по определению генотипов вируса гепатита В и чувствительности вируса гепатита В и ВИЧ к препаратам.
Кроме того, в лаборатории применяются иммуноферментный анализ (ИФА) и реакция иммунофлюоресценции (РИФ) для выявления маркеров вирусных и бактериальных патогенов.
История создания
Лаборатория диагностики ВИЧ и сопутствующих инфекций как самостоятельная структура в НИИ эпидемиологии и микробиологии была организована 01.09.1998 и сохранила название до настоящего времени.
Создание лаборатории было обусловлено тем, что проблема ВИЧ-инфекции, а также парентеральных гепатитов В и С становились все более и более актуальными и требовали внедрения новых более технологичных и эффективных методов контроля за возбудителями, разработки новых диагностических тестов.
В соответствии с приказом Министерства здравоохранения Республики Беларусь от 14.05.2012 № 546 "О возложении функций Республиканской референс-лаборатории генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С по определению генотипов/субтипов и резистентности к противовирусным препаратам ВИЧ, гепатитов В и С" на базе лаборатории функционирует «Республиканская референс-лаборатория генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С по определению генотипов/подтипов и резистентности к противовирусным препаратам ВИЧ, гепатитов В и С».
В настоящее время лаборатория оснащена современным оборудованием, что позволяет проводить научные и прикладные исследования на самом высоком уровне. На ее базе действует Республиканская референс-лаборатория по генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С.
Основные задачи лаборатории:
Елена Леонидовна ГАСИЧ
Заведующая лабораторией
доктор биологических наук, доцент
Тел.: +375-17 373 04 16
E-mail: elena.gasich@gmail.com
Гасич Елена Леонидовна окончила биологический факультет Белорусского государственного университета, кафедру микробиологии.Является доктором биологических наук, доцентом, защитила диссертационную работу на тему: «Молекулярно-генетическая характеристика вирусов гепатитов В, С и иммунодефицита человека первого типа: филогенетический анализ, генотипическая структура и популяционно-территориальное распространение» по специальности 03.02.02. – вирусология.
Результаты исследовательской деятельности опубликованы более чем в 190 печатных научных работах в отечественных и зарубежных изданиях. Со-автор патентов на изобретения. Участвует в подготовке кадров высшей квалификации. Под её руководством выполняются дипломные и курсовые студенческие работы. Читает курс лекций и проводит практически занятия на кафедре эпидемиологии и микробиологии государственного учреждения образования «Белорусская медицинская академия последипломного образования» и кафедре микробиологии, вирусологии, иммунологии учреждения образования «Белорусский государственный медицинский университет».
Направления научной деятельности: изучение эволюции вирусных инфекций и их диагностика; молекулярно-эпидемиологический мониторинг ВИЧ, парентеральных гепатитов В и С, папилломавирусной инфекции; поиск новых антивирусных средств, эффективных в отношении ВИЧ; разработка и внедрение новых диагностических средств.
Руководитель республиканской референс-лаборатории генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С.
Заведующий лабораторией:
Научные сотрудники:
Белякова Екатерина Сергеевна
Булда Кирилл Юрьевич
Бунас Анастасия Сергеевна
Головчак Юлия Владимировна
Гудель Анна Сергеевна
Дрозд Алина Михайловна
Кабанькова Анастасия Николаевна
Охремчук Артур Эдуардович
Лаборанты:
Силантьева Ольга Владимировна
Царь Александра Ивановна
В настоящее время лаборатория оснащена современным оборудованием, что позволяет проводить научные и прикладные исследования на самом высоком уровне по следующим направлениям:
В 2019 году были выполнены следующие задания:
1. «Определить распространенность HBsAg – ускользающих мутаций и HBeAg негативных случаев у пациентов с хронической формой вирусного гепатита В, разработать диагностическую тест-систему для диагностики вирусного гепатита В в режиме реального времени» подпрограммы 1 «Инновационные биотехнологии 2020» государственной программы «Наукоемкие технологии и техника» на 2016 – 2020 годы (раздел «Медицинские биотехнологии);
2. «Разработать метод определения резистентности вируса гепатита С к препаратам прямого действия и определить их распространенность у инфицированных пациентов с целью своевременной корректировки схем лечения» подпрограммы «Инфекции и биологическая безопасность» ГНТП «Новые методы оказания медицинской помощи» 2016-2020;
3. «Разработать диагностическую тест-систему для определения мутаций резистентности в р участке генома вируса гепатита В (ВГВ) у пациентов с хронической формой гепатита в, находящихся на антивирусной терапии» ГНТП «Новые методы оказания медицинской помощи» 2016-2020 гг. подпрограммы «Инфекции и биологическая безопасность» ;
4. Изучение степени инактивации ВИЧ при повторном использовании световодного инструмента при лазерных вмешательствах в образцах изделий производства ЗАО «ФОТЭК».
Международное сотрудничество:
1. Генотипирование и определение однонуклеотидных полиморфизмов микроорганизмов: сравнительные исследования нуклеотидных последовательностей, полученных на генетических анализаторах ABI 3500 (Applied Biosystems.США) и Нанофор (Синтол, Россия).
2. Выполняется международный проект по предотвращению распространения резистентных штаммов ВИЧ в странах ВЕЦА (Россия, Беларусь, Армения, Азербайждан, кыргызтан, Узбекистан, Таджикистан).
Перспективные исследования и задания, планируемые к выполнению:
1. Разработать и внедрить методы выявления лекарственной устойчивости ВИЧ-1 к ингибиторам интегразы и фармакогенетического маркера (аллель HLA-B*57:01) с целью оптимизации схемы антиретровирусной терапии;
2. Разработать и внедрить алгоритм молекулярно-генетического определения лекарственной устойчивости доминирующих генетических вариантов вируса гепатита С к ингибиторам репликации вируса;
3. Разработать и внедрить метод молекулярного типирования антигенных детерминант HBsAg вируса гепатита В;
4. Оценить распространённость клинически значимых мутаций к ингибиторам протеазы и обратной транскриптазы ВИЧ у пациентов, длительно получающих лечение антиретровирусными лекарственными средствами
Основные направления научно-практической деятельности
1. Впервые среди стран СНГ определены виды, генотипы и подтипы вируса папилломы человека (ВПЧ) высокого онкогенного риска, разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за ВПЧ высокого онкогенного риска. Отработаны условия проведения ПЦР, секвенирующей ПЦР и секвенирование с парами праймеров к L1, Е6/Е7 участкам ВПЧ-16, 18, 45. Проведенное секвенирование и последующий филогенетический анализ по данным участкам более 150 образцов позволили установить, что на территории Республики Беларусь циркулируют в основном варианты ВПЧ-16, 18, 45, занесенные недавно из стран юго-восточной Азии. Вместе с тем, было показано, что на территории страны циркулируют «старые» местные варианты ВПЧ высокого онкогенного риска, а также вирусы с Африканского континента, и это необходимо учитывать при выборе вакцин и оценке эффективности поствакцинального иммунитета. Впервые описан новый вариант ВПЧ-16 типа.
2. ВИЧ-инфекция: впервые мире описана новая уникальная рекомбинантная форма ВИЧ-1, на которую в 2013 г. получен патент Республики Беларусь № 18124, разработаны и успешно используются в лаборатории тест-системы для генотипирования ВИЧ-1 по участкам генов gag-env и pol ВИЧ-1 (рег. удостоверения № ИМ-7.95957 и ИМ-7.103886), позволяющие проводить диагностику и определять подтипы вируса, циркулирующие на территории Беларуси, расшифровывать случаи умышленного инфицирования, вспышки ВИЧ-инфекции и случаи инфицирования через кровь и ее продукты. Разработана и применяется система молекулярно-эпидемиологического мониторинга циркуляции подтипов ВИЧ-1 на территории страны. Показано, что на территории Республики Беларусь продолжает доминировать подтип А1 ВИЧ-1, на который приходится более 90% всех новых случаев инфицирования. В тоже время, в стране увеличивается количество выявленных рекомбинантных форм, на которые уже приходится более 8% новых случаев инфицирования, при этом, если ранее рекомбинантные формы на территорию страны «завозились» из-за пределов, то в последнее время наблюдается формирование новых рекомбинантных форм на территории страны. Впервые в Гомельской области у двоих пациентов выявлен подтип G ВИЧ-1 и показано, что оба пациента получили вирус из одного источника, а в Минской области у двоих пациентов выявлен новый вариант рекомбинантной формы CRF02_AG. В 300 (54,80%) из 547 изолированных и амплифицированных образцах РНК ВИЧ были выявлены мутации резистентности высокого уровня. Всего на резистентность было проверено около 1100 образцов сыворотки/плазмы крови. Определение мутаций резистентности осуществляли как с использованием коммерческой тест-системы, так и с применением разработанной нами тест-системы для генотипирования и определения мутаций резистентности ВИЧ-1. Своевременное определение резистентных штаммов ВИЧ-1 позволяет эффективнее использовать разные схемы терапии и значительно улучшать жизненный статус пациентов. В Международную базу данных GenBank передано более 300 последовательностей ВИЧ-1.
Совместно с российскими коллегами получено 6 патентов Российской Федерации на новые антивирусные соединения.
3. Гепатиты В и С
Гепатит В. Разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга циркуляции ВГВ. Выполняются исследования по генотипированию и установлению клинически значимых мутаций вируса к средствам противовирусной терапии, определению HBsAg ускользающих мутаций, мутаций в HBeAg ВГВ.
Гепатит С. Разработана система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за циркуляцией ВГС и метод выявления мутаций лекарственной устойчивости ВГС к лекарственным средствам прямой противовирусной терапии.
В лаборатории успешно осуществляется работа по оказанию платных услуг населению по диагностике, генотипированию и определению лекарственной устойчивости парентеральных гепатитов В и С, ВИЧ к средствам противовирусной терапии.
На базе лаборатории функционирует республиканская референс-лаборатория генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С.
Внедрение результатов научных исследований в учреждения практического здравоохранения
В учреждения практического здравоохранения внедрена инструктивно-методическая документация:
Продукция, выпускаемая лабораторией диагностики ВИЧ и сопутствующих инфекций
Международное сотрудничество
Лаборатория тесно сотрудничает с зарубежными коллегами. Сотрудники лаборатории работали и проходили стажировки в ведущих научных учреждениях США (Национальный институт здоровья), Японии (Национальный институт здоровья), Германии (Институт Роберта Коха и Институт физиологической химии), Голландии (Медицинский центр Амстердамского университета), Испании (Институт Карлоса IV), России (Институт вирусологии им. Д.И. Ивановского в Москве; Институт особо чистых биопрепаратов в Санкт-Петербурге; Институт технической химии в Перми; Федеральное бюджетное учреждение науки государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» в Новосибирске).
Выполняются совместные научные проекты с Федеральным бюджетным учреждением науки центральным научно-исследовательским институтом эпидемиологии Роспотребнадзора (Москва, Россия) и ЗАО «СИНТОЛ» (Россия).
Сотрудники лаборатории принимают активное участие в работе международных научно-практических конференций. В 2018 году были представлены доклады на International Symposium on HIV and Emerging Infectious Diseases (ISHEID (Марсель, Франция), Шестой конференция по ВИЧ/СПИДу в Восточной Европе и Центральной Азии (Москва, Россия), IV Российском конгрессе лабораторной медицины (Москва, Россия), 3-м межрегиональном форуме специалистов «Актуальные вопросы инфекционной патологии» (Санкт-Петербург, Россия), Международной научно-практической конференции «Молекулярная диагностика 2018» (Минск, Беларусь) и др.
В 2018 году Гасич Е.Л. была успешно защищена диссертационная работа «Молекулярно-генетическая характеристика вирусов гепатитов В, С и иммунодефицита человека первого типа: филогенетический анализ, генотипическая структура и популяционно-территориальное распространение» по специальности 03.02.02. – вирусология.
В настоящее время в лаборатории выполняется диссертационная работа на соискание учёной степени кандидата наук:
Конончик Е.С. «Совершенствование профилактики и разработка технологии изготовления вакцины против миксоматоза кроликов» по специальности 06.02.02 – ветеринарная микробиология, вирусология, эпизоотологическая иммунология с микотоксикологией.)
В 2018-2019 годах выполнены 4 дипломные работы студентами кафедры микробиологии биологического факультета Белорусского государственного университета.
2018 год
Архив публикаций
Республиканская референс-лаборатория по генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С создана на основании Приказа Министерства здравоохранения Республики Беларусь от 14.05.2012 № 546 с целью совершенствования эпидемиологического надзора за парентеральными вирусными инфекциями в Республике Беларусь.
В соответствии с поставленной целью в задачи исследования входит:
1. осуществление молекулярно-эпидемиологического надзора за распространенностью субтипов/генотипов ВИЧ, парентеральных гепатитов В и С и определение их филогенетических связей на территории республики;
2. выявление циркуляции резистентных штаммов ВИЧ, гепатитов В и С, проведение анализа их распространения;
3. участие в программе контроля качества лабораторных исследований путем оценки качества молекулярно-генетической диагностики ВИЧ-инфекции и гепатитов В и С диагностическими лабораториями Республики Беларусь;
4. участие в проведении медицинских испытаний тест-систем, предназначенных для диагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С методом полимеразной цепной реакции, на этапе регистрации, входного контроля качества и контроля на этапе их эксплуатации с предоставлением аналитических справок;
5. участие в проведении арбитражных исследований в случаях предоставления организациями здравоохранения рекламаций в Министерство здравоохранения на качество диагностических тест-систем для определения маркеров ВИЧ, парентеральных гепатитов В и С;
6. участие в разработке нормативных правовых документов по организации генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С в Республике Беларусь, стандартизация лабораторных исследований, унификация приемов обработки и анализа информации и доведение указанной информации до клинико-диагностических лабораторий.
7. участие в проведении экспертиз случаев инфицирования реципиентов вирусами гепатита В и С, ВИЧ при парентеральном введении компонентов крови и случаев инфицирования лиц артифициальным путем;
8. участие в расшифровке вспышек и случаев инфицирования вирусами гепатита В и С, ВИЧ;
9. участие в научной работе, международное сотрудничество по актуальным вопросам генодиагностики ВИЧ и парентеральных гепатитов В и С.
В соответствии с возложенными задачами Республиканская референс-лаборатория осуществляет следующие функции:
1. внедрение в практику лабораторной и эпидемиологической служб новых методов и технологий генодиагностики ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С;
2. создание коллекции образцов сывороток/плазмы крови, содержащих маркеры (РНК/ДНК) разных субтипов/генотипов ВИЧ, вирусов гепатитов В и С;
3. создание банка штаммов ВИЧ разных субтипов, обмен штаммами с ведущими международными центрами и национальными лабораториями других стран;
4. определение резистентности ВИЧ и вируса гепатита В к применяемым противовирусным препаратам;
5. информирование Министерства здравоохранения, управлений здравоохранения о субтипах/генотипах штаммов ВИЧ, вирусов гепатита В и С, выявляемых в Республике Беларусь;
6. участие в разработке критериев контроля эффективности генодиагностики;
7. разработка контрольных панелей сывороток крови, содержащих маркеры ВИЧ, парентеральных гепатитов В и С, на основе анализа циркулирующих на территории Республики Беларусь субтипов и генотипов вирусов гепатита В и С, ВИЧ;
8. организационно-методическое руководство и оказание консультативной помощи диагностическим лабораториям республики по вопросам генодиагностики ВИЧ, парентеральных гепатитов В и С;
9. участие в подготовке и повышении квалификации специалистов диагностических лабораторий по генодиагностике ВИЧ-инфекции, парентеральных гепатитов В и С, внедрение методов молекулярной эпидемиологии в работу диагностических лабораторий;
10. участие в организации и проведении конференций, семинаров по вопросам диагностики ВИЧ и парентеральных гепатитов В и С, участие в республиканских и международных конференциях по профильным вопросам;
11. проведение информационно-образовательной работы среди населения, пропагандирование, в том числе через средства массовой информации, принципов здорового образа жизни.