Основные направления деятельности
В процессе эпидемиологического слежения за вакциноуправляемыми инфекциями и обеспечения их дифференциальной диагностики в поле деятельности лаборатории попали и другие, клинически сходные с ними, инфекции. К направлениям деятельности лаборатории относится серологическая и молекулярно-генетическая диагностика парвовирусной (В19) инфекции человека, установление ее эпидемиологических характеристик и генетического разнообразия возбудителя. Разрабатывается методология и подходы к оптимизации молекулярной диагностики кишечных инфекций у детей, вызванных не только ротавирусами, но и другими вирусными и бактериальными возбудителями.
На базе лаборатории вакциноупраляемых инфекций организована работа национальных (республиканских) референс-центров по полиомиелиту (с 1997 г.), по кори/краснухе (с 2002 г.), которые входят в состав лабораторной сети ВОЗ.
С 2009 г. на базе лаборатории вакциноуправляемых инфекций функционирует Региональная лаборатория ЕРБ ВОЗ по ротавирусной инфекции для стран, входящих в сеть надзора за этой инфекцией, осуществляемого при поддержке ВОЗ (Армения, Азербайджан, Грузия, Молдова, Узбекистан, Украина, Таджикистан). С 2017 г. лаборатория выполняет функцию Региональной лаборатории и для стран региона, участвующих в Глобальном надзоре за диареями у детей.
Елена Олеговна САМОЙЛОВИЧ
Заведующая лабораторией:
доктор медицинских наук, профессор
Тел.: +375-17 320 88 99
E-mail: esamoilovich@gmail.com
Доктор медицинских наук, профессор, заведующая лабораторией вакциноуправляемых инфекций Республиканского научно-практического центра эпидемиологии и микробиологии Министерства здравоохранения Республики Беларусь Елена Олеговна Самойлович — автор 300 научных работ, эксперт Всемирной организации здравоохранения.
Окончанив с золотой медалью Трокельскую десятилетку (Гродненская область), Елена стала студенткой санитарно-гигиенического факультета Минского государственного медицинского института, который в 1984г. окончила с красным дипломом. По распределению была направлена в Москву для поступления в целевую аспирантуру при Институте вирусологии им. Д.И. Ивановского АМН СССР. Закончила аспирантуру и защитила кандидатскую диссертацию в 1987г. В этом же году поступила на работу в Белорусский НИИ эпидемиологии и микробиологии (сейчас РНПЦ эпидемиологии и микробиологии), где работает и сейчас. С 1996 года является руководителем лаборатории, в 2004 году защитила докторскую диссертацию по двум специальностям — «вирусология», «эпидемиология».
— Думаю, что являюсь примером человека, правильно выбравшего свою профессию, — откровенно призналась Елена Олеговна. — Медицина была выбрана еще в школе, во многом благодаря советам моих родителей и учителей. А вот конкретное направление сформировалось во время учебы в институте и аспирантуре. Сейчас наша лаборатория занимается диагностикой и молекулярно-эпидемиологическим мониторингом инфекций, в отношении которых существуют или разрабатываются вакцины. Поскольку благодаря вакцинации заболеваемость многими инфекционными заболеваниями существенно снижена, вплоть до ликвидации некоторых из них (к примеру, «ушла» в историю натуральная оспа, на стадии ликвидации находятся полиомиелит, корь, краснуха), для каждой страны чрезвычайно важно иметь возможность своевременного обнаружения этих вирусов в случае их заноса на территорию и недопущения их распространения. Много инфекций, над снижением заболеваемости которыми нужно работать. Благодаря развитию науки сегодня мы можем узнать, это наш «белорусский» вирус или он завезен из другой страны. Если «чужой», то с большой долей вероятности можем определить, какая страна его «импортировала». Не могу сказать, что моя работа легкая. Она требует очень большой отдачи. Приходится много работать и дома — над литературой, диссертационными работами учеников, написанием статей. Очень важно для любого научного сотрудника знание английского языка. Над этим тоже пришлось много работать уже в зрелом в возрасте. "Воранаўская газета" от 27 января 2018 г.
Самойлович Елена Олеговна – зав. лабораторией, д.м.н., проф.
Колодкина Валентина Леонидовна – главный научн. сотр., д.м.н.
Ермолович Марина Анатольевна – главный научн. сотр., д.м.н.
Семейко Галина Валерьевна – ведущий научн. сотр., к.б.н.
Ухова Ирина Федоровна – ст. научн. сотр., к.б.н.
Новацкая Алина Сергеевна – стажер мл. научн. сотр.
Каравацкая Инга Алексеевна – лаборант 1 категории
Климко Алла Ивановна – лаборант 2 категории
Назаренко Лариса Анатольевна – лаборант
Обеспечено осуществление лабораторного компонента эпидемиологического надзора за вакциноуправляемыми инфекциями (лабораторная диагностика, молекулярно-эпидемиологический мониторинг циркуляции возбудителя и сероэпидемиологический мониторинг популяционного иммунитета). Результаты выполненных исследований позволили оптимизировать лабораторную диагностику, установить реальную заболеваемость вакциноуправляемыми инфекциями и ее причины и обосновать тактику дальнейшей вакцинопрофилактики. По каждой из курируемых лабораторией инфекций разработаны и утверждены инструкции по применению, в которых изложены алгоритмы современной лабораторной диагностики и молекулярно-эпидемиологического мониторинга.
Полученные в лаборатории результаты убедительно документировали многолетнее отсутствие циркуляции как диких, так и вакцинородственных полиовирусов и способствовали разработке схем вакцинации против полиомиелита, позволивших обеспечить достаточно прочный иммунитет населения к этой инфекции.
Результаты молекулярно-эпидемиологического мониторинга кори и краснухи доказали отсутствие эндемичной циркуляции вируса кори (с 2004 г.) и вируса краснухи (с 2007 г.) и стали одним из оснований для верификации элиминации обеих этих инфекций в Республике Беларусь Европейской Региональной комиссией по верификации элиминации кори и краснухи.
Результаты молекулярно-эпидемиологического мониторинга эпидемического паротита показали отсутствие эндемичной циркуляции вируса и свидетельствуют о том, что выявление IgM антител к вирусу паротита следует рассматривать как вероятный, но недостаточный критерий для подтверждения диагноза эпидемического паротита, поскольку они могут быть обусловлены наличием перекрестно реагирующих антител при других вирусных инфекциях (вызванной цитомегаловирусом, вирусом Эпштейна-Барр, энтеровирусом и др.). С целью верификации диагноза эпидемического паротита необходимо проведение молекулярно-генетического обследования.
Выполненное полногеномное секвенирование штаммов C. diphtheriae позволило получить новую информацию о геноме возбудителя, углубить понимание генетической структуры популяции, оценить значимость молекулярных методов типирования и биотипирования, понять механизм клональной экспансии у C. diphtheriae. Показано, что основные сиквенс-типы и риботипы циркулирующих штаммов возбудителя дифтерии ассоциированы с группированием их на основе филогенетического анализа кор-генома. Относительная роль рекомбинаций и мутаций в эволюции двух доминирующих клонов нетоксигенного сиквенс-типа ST5 и токсигенного клона сиквенс-типа ST8 различалась. Главной движущей силой в эволюции нетоксигенных штаммов ST5 была рекомбинация. Мутации играют большую роль в обеспечении разнообразия и распространения токсигенного клона сиквенс-типа ST8.
Разработанный алгоритм лабораторной диагностики коклюша позволил установить коциркуляцию разных видов рода Bordetella, доминирование B. pertussis, низкий уровень циркуляции B. parapertussis, B. holmesii и отсутствие циркуляции B. bronchiseptica в Республике Беларусь.
Оптимизированная диагностика острых кишечных инфекций у детей с использованием количественной ОТ-ПЦР в реальном времени (в формате TaqMan Array Card) позволила выявить 12 энтеропатогенов, среди которых наиболее часто встречающимся является Rotavirus (выявлен в 57,9% образцов), реже Norovirus (14,0%), Campylobacter (7,5%), Clostridium difficile (5,6%), Salmonella (4,7%) и Bacteroides fragilis (3,7%). Другие патогены обнаружены в 1-2% случаев.
С применением TaqMan Array Card этиологическая роль шигатоксин-продуцирующей Escherichia coli (STEC) была подтверждена в 37,0% случаев гемолитико-уремического синдрома (ГУС). До применения этого метода этиологическую расшифровку диагноза в Республике Беларусь имели только 18% постдиарейных ГУС. Наряду со STEC были выявлены другие патотипы диареегенной E. coli (EPEC и EAEC) и другие патогены (вирусы – рота, норо, астро, адено, бактерии – Campylobacter, Clostridium difficile, Bacteroides fragilis, простейшие – Cryptosporidium), их роль в этиологии ГУС или утяжелении клинического течения ГУС изучается.
Результаты генотипирования ротавирусов показали, что на протяжении 2018-2022 гг. в г. Минске циркулировали преимущественно широко распространенные генотипы: G1P[8], G2P[4], G3P[8], G9P[8]. На их долю приходилось 92,5% (86/93) исследованных ротавирусов. Еще три генотипа (G3P[9], G2P[8], G9P[4]) относились к редко встречающимся, частота их выявления составила 5,4%. В течение каждого года наблюдалась одновременная циркуляция 2-5 генотипов, при этом доминирующим являлся генотип G3P[8] (51,6%), он единственный обнаруживался в течение всех 5 лет наблюдения и на протяжении 4 лет выявлялся с частотой 50,0-94,1%.
Внедрение лабораторной верификации парвовирусной инфекции показало, что в современных условиях эта инфекция играет доминирующую роль в этиологической структуре вирусных экзантем. По результатам динамического молекулярно-генетического мониторинга установлено, что эндемичным генетическим вариантом парвовируса В19 в Республике Беларусь является генотип 1, субгенотип 1а. На протяжении многолетнего периода наблюдения (с 2005 г.) циркулируют штаммы двух геновариантов субгенотипа 1а: 1а1 (32,2%) и 1а2 (66,5%). В период высокой заболеваемости и в последующие 1-2 года преимущественное распространение имел геновариант 1а2, в годы длительного эпидемического благополучия – 1а1. Выявленные 3 штамма вируса не кластеризовались ни с одним из известных геновариантов и при дальнейшем филогенетическом анализе были классифицированы как новый, не описанный ранее геновариант 1а3.
Установлено, что парвовирус В19 является значимым этиологическим агентом неиммунной водянки плода (обуславливает 22,2% случаев), частота выявления водянки плода парвовирусной этиологии в Республике Беларусь составляет 1,5 на 100000 новорожденных. Обеспечение лабораторной верификации случаев пренатального инфицирования парвовирусом В19 с развитием неиммунной водянки плода послужило основанием для проведения акушерами своевременной жизнесохраняющей терапии.
Своими исследованиями и разработками лаборатория вносит вклад в работу практического здравоохранения. За последние пять лет (2019-2023 гг.) были разработаны семь инструкций по применению, которые внедрены в работу учреждений здравоохранения страны.
Разработанные тест-системы: Набор реагентов для выявления ДНК парвовируса В19 в режиме реального времени «Parvovirus B19», набор реагентов для обнаружения ДНК возбудителей рода Bordetella методом ПЦР в режиме реального времени «Bordetella Real-Time PCR». В настоящее время ведутся работы по созданию ПЦР тест-системы для детекции шигатоксин-продуцирующей Escherichia coli (STEC).
Подготовка кадров высшей квалификации
В лаборатории ведется большая работа по поддержанию и развитию созданной школы эпидемиололгов и вирусологов.
Таблица. Диссертационные исследования, выполненные в лаборатории вакциноуправляемых инфекций за период 2000-2023 гг.
Автор, |
Название работы |
Специальность |
Научное руководство
|
Год |
Белецкая Татьяна Станиславовна, |
«Молекулярно-биологический анализ полиовирусов, изолированных в Беларуси» |
03.00.06 – вирусология |
Доктор мед. наук |
2001 |
Ермолович |
«Вакциноассоциированный полиомиелит в Беларуси: вирусологическая и иммунологическая характеристика» |
03.00.06 – вирусология |
Доктор мед. наук |
2003 |
Самойлович |
«Изменчивость вакцинных полиовирусов и закономерности формирования иммунитета в условиях элиминации диких вирусов полиомиелита» |
03.00.06 – вирусология 14.00.30 – эпидемио-логия |
Доктор мед. наук, |
2004 |
Свирчевская Екатерина Юрьевна, |
«Эпидемиологический и вирусологический мониторинг кори на этапе ее элиминации в Республике Беларусь» |
14.00.30 – эпидемио-логия, 03.00.06 – вирусология |
Доктор мед. наук |
2008 |
Семейко |
«Лабораторная диагностика краснухи и молекулярно-генетическаяактеристика возбудителя» |
03.00.06 – вирусология |
Доктор мед. наук Е.О. Самойлович |
2008 |
Ухова
|
«Особенности циркуляции полио-миелитных и неполиомиелитных энтеровирусов в условиях приме-нения живой и инактивированной вакцин против полиомиелита» |
03.00.06 – |
Доктор мед. наук, Е.О. Самойлович |
2010 |
Хныков Алексей Михайлович, |
Клинико-эпидемиологические особенности аденовирусной инфекции, методы терапии и профилактики |
14.01.09 – инфекционные болезни |
Доктор мед. наук, проф. В.М. Семенов,
доктор мед. наук |
2014 |
Шиманович Вероника Петровна, |
Совершенствование системы эпидемиологического надзора и вакцинопрофилактики эпидемического паротита в Республике Беларусь |
14.02.02 – эпидемиология |
Доктор мед. наук Е.О. Самойлович |
2014 |
Климович Наталья Владимировна, |
Клиническое значение и структура проявлений парвовирусной В19 инфекции в современных условиях |
04.01.09 – инфекционные болезни |
Доктор мед. наук, проф. В.А. Матвеев,
канд. мед. наук |
2017 |
Полякова Надежда Витальевна, |
Молекулярно-генетическая и эпидемиологическая характеристика ротавирусной инфекции в Республике Беларусь |
03.02.02 – вирусология |
Доктор мед. наук, проф. |
2018 |
Колодкина Валентина Леонидовна, |
«Молекулярно-генетическая характеристика возбудителя дифтерии и закономерности формирования протективного противодифтерийного иммунитета» |
03.02.03 – микробиология |
Доктор мед. наук, проф., член-корр НАНБ |
2019 |
Ермолович |
Парвовирусная инфекция в Республике Беларусь: диагностика, генетическая характеристика возбудителя и молекулярно-эпидемиологический мониторинг |
03.02.02 – вирусология 14.02.02 – эпидемиология |
Доктор мед. наук, проф. |
2020 |
С 2000 по 2023 гг. в лаборатории выполнено 3 докторских (Самойлович Е.О., Колодкина В.Л., Ермолович М.А.) и 9 кандидатских диссертаций (Белецкая Т.С., Ермолович М.А., Свирчевская Е.Ю., Семейко Г.В., Ухова И.Ф., Хныков А.М., Шиманович В.П., Климович Н.В., Полякова Н.В.) (табл.)
Лаборатория обладает необходимой материально-технической базой и штатом специалистов и является эффективным структурным подразделением РНПЦ эпидемиологии и микробиологии. Сотрудники лаборатории прошли обучение за рубежом, в крупных международных центрах США, Великобритании, Германии, Франции, Финляндии, Люксембурга, России.
Лаборатория активно сотрудничает как со специалистами медицинских учреждений Республики Беларусь (медицинские университеты, учреждения санитарно-эпидемиологической службы, инфекционные больницы и др.), так и со специалистами из ближнего и дальнего зарубежья. Лабораторию неоднократно посещали специалисты ВОЗ и международных научных центров с целью оценки деятельности и планирования дальнейших совместных исследований (фото).
Ежегодно сотрудники лаборатории представляют результаты своих научных исследований на республиканских и международных конференциях, публикуют в белорусских и международных медицинских изданияхОсновные опубликованные статьи за 2021-2023 гг.